Jyrki Turunen 17.3.2002
työselostus MIKRO 220
opiskelijanro:
012079087
Oman bakteerin kuvaus
1. Johdanto
Työn tarkoituksena on eristää ja tunnistaa jokin bakteeri.
Oma näyte kylpyhuoneen viemäristä maanantaina 18.2.2002 n. klo 8.00.
2.
Materiaalit ja menetelmät
Bakteerin eristäminen ja tunnistaminen sisälsi seuraavat
vaiheet:
- Puhdasviljelmän eristäminen s.27 (harjoitustyömoniste)
-
luonnossa mikrobit esiintyvät sekaviljelminä
-
kun halutaan tutkia yksittäisten organismien
ominaisuuksia, ne on eristettävä puhdasviljelmäksi
-
pintanäyte alginaattivillatikkua käyttäen
- Mikrobien ravintovaatimukset s.29 (harjoitustyömoniste)
-
mikrobien ravintovaatimukset ovat vaihtelevia
-
ravintoalustat voidaan jakaa kahteen ryhmään:
synteettiset ja kompleksiset
-
valmistusvaiheet: aineiden punnitseminen, liuottaminen,
pH:n tarkistus ja säätö, annostus, tulpittaminen ja sterilointi
- Entsymaattiset reaktiot s.33 (harjoitustyömoniste)
-
elintoimintojen ylläpitäminen, kasvu ja lisääntyminen
tapahtuvat entsyymien avulla
-
useimmat eksoentsyymit katalysoivat hydrolyyttisiä
reaktioita
-
entsymaattisilla reaktioilla tärkeä sija mikrobien
luonnehdinnassa ja identifioinnissa
- Bakteerien antibiootti- ja sulfaherkkyys s.49 (harjoitustyömoniste)
-
antibioottiherkkyyden määrittäminen on jokapäiväinen
kliininen ongelma
-
herkkyysmääritysmenetelmiä on useita
-
tavallisin on agar-diffuusio, tabletin ympärille syntyy
estovyöhyke
- Desinfektioaineiden tehokkuus s.51 (harjoitustyömoniste)
-
eri desinfektioaineet vaikuttavat mikrobeihin eri
tavoin
-
toiset denaturoivat proteiineja, liuottavat solukalvon
lipidejä, hapettavat tai sitoutuvat entsyymien SH-ryhmiin jne.
-
tutkitaan eri desinfektioaineiden vaikutusta
omaan bakteeriin
3.
Tulokset
- Puhdasviljelmät: Eristetty ja jatkoviljelty seuraavat mikrobit:
J1= pyöreä vaalea pesäke
J2= pyöreä vaalea pesäke
J3= keltainen pesäke
Jatkoviljelyt osoittivat, että J1 ja J2 samoja
bakteereja, jätetään J2 pois. Pintahajotukset J1 ja J3
bakteereista TGY-maljoille.
2. Mikrobien ravintovaatimukset tulokset:
Bakteeri
|
ravintoliemi
|
semisolidi eli puolijähmeä ravintoagar
|
ravinto-glukoosi-
liemi
|
ravinto-hiivauute-liemi
|
glukoosi-suolaliemi
|
J1 |
+++
|
K
|
+++
|
+++
|
+
|
J3
|
+++
|
K
|
+++
|
+++
|
+
|
+++ hyvin samea
K kasvua, E ei kasvua
++ kohtalaisen samea
+ heikosti samea
- ei sameutta
kontrollit puhtaita
3. Entsymaattiset reaktiot tulokset:
|
|
|
|
|
hapon
|
muo-dostus
|
glu-koo-sista
|
|
|
|
|
|
bak-teeri
no.
|
tärk-kelyk-sen
hydro-lyysi
|
pro-teo-lyysi
|
lipo-lyysi
|
nit-raatin pelkis-tys
|
avoin putki
|
suljettu
putki
|
ener-gia-meta-bolia*
|
kaa-sun-
muo-dos-tus
|
kata-laasi-testi
|
oksi-daasi
-testi
|
Gram-reak-tio
|
solun
muoto
|
J1 |
-
|
-
|
-
|
+
|
+
|
+
|
F
|
+
|
+
|
-
|
Gram-
|
sauva
|
J3
|
+
|
+
|
+
|
+
|
+
|
+
|
F
|
+
|
+
|
-
|
Gram+
|
kokki
|
* R = respiratiivinen
F =
fermentatiivinen
J1 = vaalea pesäke, pieni sauva, gram-negatiivinen
J3 = keltainen pesäke, pieni kokki, gram-positiivinen,
- Bakteerien antibiootti- j a sulfaherkkyys tulokset:
organismi
|
antibiootti
|
tulos
|
J3 (gram+) |
streptomysiini
|
1
|
|
penisilliini
|
4
|
|
sulfonamidi
|
2
|
|
kloramfenikoli
|
2
|
|
kanamysiini
|
1
|
herkkyysluokka
|
antibiootit
|
sulfa
|
herkkä (1)
|
³ 28 mm
|
³ 32 mm
|
kohtalaisen herkkä (2)
|
23-27 mm
|
24-31 mm
|
kohtalaisen resistentti (3)
|
15-22 mm
|
15-23 mm
|
resistentti (4)
|
£ 14 mm
|
£ 14 mm
|
Bakteeri on täysin resistentti käytetylle penisilliinille,
tuottaa penisillinaasia. Muille bakteeri on herkkä tai kohtalaisen herkkä.
Yleisesti gram-negatiiviset ovat resistenttejä penisilliinille ja suurin osa
gram-positiivisista herkkiä.
5. Desinfektioaineiden tehokkuus
-
tulokset
organismi
|
desinfektioaine
|
aika/min
2,5
|
5
|
10
|
15
|
posit.
kontrolli
|
negat.
kontrolli
|
J3 |
Hibitane 1%
|
+
|
-
|
-
|
-
|
|
|
J3
|
fenoli 1%
|
+
|
+
|
+
|
+
|
+
|
-
|
J3
|
70% etanoli
|
+
|
+
|
-
|
-
|
|
|
J3
|
vetyperoksidi 3%
|
-
|
-
|
-
|
-
|
|
|
+ = kasvua, - = ei kasvua
4.
Tulosten tarkastelu
Desinfektioaineista negatiivisena kontrollina oli vain
fenoli, muut ryhmät tekivät muista kontrollit.
Organismi ei välitä 1%:sta konsentraatiosta fenolia mitään,
kenties yli 1 prosentin konsentraation vaikutus olisi merkittävämpi.
Etanoli vaikuttaa vasta 5 minuutin jälkeen, vaikutus
perustuu proteiinien denaturoitumiseen, mutta voi myös häiritä membraaneja ja
liuottaa rasvakomponentteja. Suositeltu konsentraatio on 70%, mutta
konsentraatiot välillä 60% ja 95% näyttävät tappavan yhtä tehokkaasti. Puhdas
etanoli ei ole niin tehokas, koska denaturoituminen vaatii vettä.
Bakteeri tuhoutuu täysin vetyperoksidin vaikutuksesta,
käytetyistä desinfektioaineista tehokkain. Vetyperoksidi hajoaa nopeasti
katalaasin vaikutuksesta vedeksi ja kaasumaiseksi hapeksi. Hibitanella on
toiseksi tehokkain estovaikutus, kloorilla on aina hyvä vaikutus elämää
tuhoavasti.
Tärkeimpiä tehdyistä testeistä olivat entsymaattiset testit
ja gram-värjäys.
Päälähtökohtana bakteerin tunnistamisessa voidaan pitää sen
gram-värjäys tulosta, jonka jälkeen aletaan tutkimaan entsyymitestien tuloksia
ja pesäkkeen ulkonäköä, myös bakteerin metabolia on olennainen.
J1 bakteerin osalta päädyin Escherichia coli
bakteeriin. Pesäkkeet olivat maljalla vaaleita ja kiiltäviä. Gram-värjäys
osoitti sen olevan gram-negatiivinen ja mikroskopointi paljasti sen pieneksi
sauvaksi, toisaalta bakteeri saattaisi olla myös samaan ryhmään kuuluva Enterobacter
aerogenes. Asian varmistamiseksi tulisi tehdä jatkotestejä.
J3 bakteeri oli pieni gram-positiivinen kokki, jonka
pesäkkeet olivat maljalla keltaisia. Bakteeri on resistentti penisillinille.
Muille antibioottitestissä käytetyille antibiooteille bakteeri on herkkä tai
kohtalaisen herkkä. Yleisesti gram-negatiiviset ovat resistenttejä
penisilliinille ja suurin osa gram-positiivisista herkkiä. Bakteeri J3 kasvoi
myöskin fenolissa eli se metaboloi sitä. Yleensä fenoli inhiboi
gram-positiivisia bakteereja muttei gram-negatiivisia. Tuloksia tarkastellessa
alkaisi herkästi epäilemään omaa työtään, mutta niin emme tee ja vedämme
johtopäätöksiä näillä tiedoilla.
Mikroskooppipreparaateissa oli diplokokkeja ja
klustereita. Päädyin Staphylococcus aureus bakteeriin.
5.
Kirjallisuus
Mikrobiologia 220 laboratorioharjoitukset: Helsingin
yliopisto Soveltavan kemian ja mikrobiologian laitos 2002
Tortora,
Funke, Case 2001. Microbiology an introduction: seventh edition